CN106794201A - 包含新型温度敏感性分枝杆菌菌株的对分枝杆菌感染症的疫苗组合物 - Google Patents

包含新型温度敏感性分枝杆菌菌株的对分枝杆菌感染症的疫苗组合物 Download PDF

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Abstract

本申请公开一种温度敏感性分枝杆菌M.paragordonae(菌株49061)菌株及包含该菌株的疫苗组合物。本申请的疫苗在接种时在皮肤及皮下进行增殖,从而刺激免疫,但由于只能在低于体温的温度下生长,在体内中心抑制了增殖,故感染可能性低,因此在分枝杆菌引起的疾病的预防疫苗及免疫治疗中能够安全及有效地使用。

Description

包含新型温度敏感性分枝杆菌菌株的对分枝杆菌感染症的疫 苗组合物
技术领域
本申请属于有关采用温敏感型分枝杆菌菌株的分枝杆菌感染症疫苗的技术领域。
背景技术
分枝杆菌(Mycobacterium)由包含结核分枝杆菌、牛分枝杆菌及麻风分枝杆菌、鸟分枝杆菌复合群(M.avium complex)及龟分枝杆菌复合群(脓肿分枝杆菌-龟分枝杆菌(M.abscessus-chelonae)complex)的约150株菌种组成。其中,结核分枝杆菌、牛分枝杆菌和麻风分枝杆菌被分为绝对病原菌,剩余分枝杆菌被统称为非结核性分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,下称NTM)而区分,这些分枝杆菌不仅对人类引起结核和麻风,还对鸟类、家畜等引起各种疾病。
其中,结核(Tuberculosis,TB)仍然是世界上排名靠前的死亡原因之一,这一情况因多重耐药(MDR)结核分枝杆菌的出现而更加严重。
结核一般可通过长期的抗生素治疗来进行调节,但由于对抗生素产生耐性,而且难以彻底监控患者是否遵守治疗程序,还因带菌者即使没有症状也有可能感染他人,因此难以阻止菌的传播。
因此,采用有效的疫苗来进行预防是阻止结核传播的更加有效的方法。
此外,在除结核之外的非结核性分枝杆菌菌种中,除鸟分枝杆菌复合群(M.aviumcomplex)之外,在韩国最频繁分离的菌为龟分枝杆菌复合群菌(M.abscessus-M.chelonae)(Ryoo SW,Shin S,Shim MS et al.,Spread of nontuberculous mycobacteria from1993to 2006in Koreans.J Clin Lab Anal.2008;22(6):415-20)。根据最新报告,其中马赛分枝杆菌(M.massiliense)(M.abscessus subsp.bolletii)菌种在韩国分离的龟分枝杆菌复合群(脓肿分枝杆菌-龟分枝杆菌复合群)中约占一半左右(46.5%)(Kim HY,Kook Y,Yun YJ et al.,Proportions of Mycobacterium massiliense and Mycobacteriumbolletii strains among Korean Mycobacterium chelonae-Mycobacterium abscessusgroup isolates.J Clin Microbiol.2008;46(10):3384-90)。已知被这种M.abscessus所属菌种感染时,因对抗生素的先天性耐性等,治疗失败率和死亡率明显高。因此,亟需开发一种针对M.abscessus菌种的新型疫苗。
以往作为对结核的预防疫苗最广泛使用的是BCG(Mycobacterium bovis BacilleCalmette-Guerin,牛分枝杆菌卡介苗)。BCG对部分在幼儿期产生的结核有效果,但对成人中发现的具有较强传染性的结核,其效果有限。而且,据报道BCG会引起淋巴腺炎、局部骨组织感染及全身感染等副作用。
最近趋势是温度敏感性菌株及减毒活菌作为对特定细菌的疫苗来开发。尤其温度敏感性菌株的疫苗开发受到更大的关注,其原因是人类和动物的体外(皮肤等)到体内(脏器等)存在温度梯度。目前正在开发温度敏感性菌株,该菌株具有能在皮肤等相对低的温度下生长而刺激局部免疫的能力,但在脏器等体内不能生长(Barry et al.,Temperature-sensitive bacterial pathogens generated by the substitution of essentialgenes from cold-loving bacteria:potential use as live vaccines.J MolMed.2011;89:437-444)。其中最广为人知的是Sabin polio疫苗和FluMist iinfluenza疫苗(Maassab HF and Bryant ML,The development of live attenuated cold-adaptedinfluenza virus vaccine for humans.Rev Med Virol.1999;9:237-244)。而且,当前趋势为以兽医学目的开发研究温度敏感性菌株(Chalmers et al.,Vet Rec.1997;141:63-67,Jackwood and Saif,Avian Dis.1985;29:1130-1139,Morrow et al.,AvianDis.1998;42:667-670)。然而,通过人为的基因转换而形成的温度敏感性菌株的稳定性低且难以保持。
WO1998-056931公开了一种采用减毒重组分枝杆菌的免疫原性组合物或者疫苗组合物,该疫苗组合物采用结核分枝杆菌重组菌株,该结核分枝杆菌重组菌株的与嘌呤及嘧啶生物合成相关的基因灭活。
美国公开专利2013-0101623涉及一种新型分枝杆菌菌株及结核疫苗组合物,公开了包含减毒结核分枝杆菌(M.tuberculosis)的疫苗组合物。
目前亟需开发一种与以往技术不同的基于新型菌株的新型疫苗组合物。
发明内容
本申请的目的是提供一种基于新型菌株的对分枝杆菌感染症的疫苗,所述分枝杆菌包括结核分枝杆菌及牛分枝杆菌,所述结核分枝杆菌包括龟分枝杆菌复合群。
本申请的一方面提供一种保藏编号为KCTC12628BP的paragordonae分枝杆菌(Mycobacterium paragordonae,菌株49061)菌株。
本申请的另一方面提供一种对分枝杆菌感染的疫苗组合物,该疫苗包含本申请的温度敏感性菌株及药学上可接受的赋形剂。
本申请的疫苗组合物起作用的分枝杆菌感染症在本领域中是公知的,只要是本领域技术人员可易于判别或诊断出因感染的疾病。这种分枝杆菌感染症例如包括肺疾病、淋巴腺炎、皮肤软组织感染症、骨感染症或播散性疾病,但并不限于此。引起这种疾病(本申请的疫苗对这种疾病起作用)的分枝杆菌包括NTM(非结核性分枝杆菌,nontuberculousmycobacteria)、快速生长型NTM、结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)或牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis),所述NTM为龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium cheloneicomplex)、鸟分枝杆菌复合群(M.avium complex)(MAC)、鸟分枝杆菌(M.avium)、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)、脓肿分枝杆菌(M.abscessus)或马赛分枝杆菌(M.massiliense),但并不限于此。
本申请的疫苗中包含的菌株可为活菌、减毒活菌或灭活菌株。尤其是,本申请的菌株可为温度敏感性菌株,其作为活菌可安全地使用。
本申请的疫苗组合物在必要时可进一步包含佐剂,本领域技术人员可以考虑效果而选择适当的种类及量。在一实现例中,佐剂包括氢氧化铝、磷酸铝、硫酸铝钾、交联聚丙烯酸聚合物、双十八烷基二甲基溴化铵(DDA,dimethyldioctadecyl-ammonium bromide)、免疫调节物质、乳铁蛋白或γ-干扰素(IFN-γ)诱导剂中的一种以上,但并不限于此。在另一实现例中,作为佐剂的交联聚丙烯酸聚合物包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质包括IFN-γ、IL-1(白细胞介素-1)、IL-2(白细胞介素-2)或IL-12(白细胞介素-12),所述IFN-γ诱导剂包括poly I:C(聚肌胞苷酸)。在另一实现例中,作为佐剂的氢氧化铝、磷酸铝或硫酸铝钾的含量可为0.05~0.1wt%,所述交联聚丙烯酸聚合物的含量可为0.25wt%。
本申请在另一方面还提供一种分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,该方法包含步骤:对需要治疗或预防分枝杆菌感染症的对象,给予有效量的本申请的疫苗组合物。
在本申请的一实现例中,分枝杆菌感染症由NTM(nontuberculousmycobacteria)、结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)或牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)引起的。在另一实现例中,NTM包括龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium chelonei complex)、鸟分枝杆菌复合群(M.avium complex)(MAC)、鸟分枝杆菌(M.avium)、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)、脓肿分枝杆菌(M.abscessus)或马赛分枝杆菌(M.massiliense)。
本申请的疫苗起作用的分枝杆菌感染症包括肺疾病、淋巴腺炎、皮肤软组织感染症、骨感染症或播散性疾病,本领域技术人员能够正确了解这些疾病的定义及判断标准来判别需要由本申请的疫苗进行治疗的对象或患者。
在本申请的方法中使用的疫苗所包含的菌为活菌、减毒活菌或灭活菌,尤其是作为温度敏感性菌株,能够作为活菌更加安全及有效地使用。本领域技术人员能够考虑具体感染菌或疾病的种类、感染程度或疾病程度、对象的原发疾病等来给予适当量。
在本申请的方法中使用的疫苗可进一步包含佐剂,本领域技术人员能够考虑具体感染菌或疾病的种类、感染程度或疾病程度、对象的原发疾病等来选择与疫苗共同使用的佐剂,例如佐剂包括氢氧化铝、磷酸铝、硫酸铝钾、交联聚丙烯酸聚合物、双十八烷基二甲基溴化铵(DDA,dimethyldioctadecyl-ammonium bromide)、免疫调节物质、乳铁蛋白或IFN-γ诱导剂中的一种以上。在一实现例中,交联聚丙烯酸聚合物可包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质可包括IFN-γ、IL-1、IL-2或IL-12,所述IFN-γ诱导剂可包括poly I:C。在另一实现例中,交联聚丙烯酸聚合物包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质包括IFN-γ、IL-1、IL-2或IL-12,所述IFN-γ诱导剂包括poly I:C。
本申请的温度敏感性分枝杆菌M.paragordonae(菌株49061)菌株及包含该分枝杆菌的疫苗组合物能够有效地用于包括龟分枝杆菌复合群及结核分枝杆菌、牛分枝杆菌的分枝杆菌感染症的预防。体内温度从皮肤到体内脏器呈温度升高的梯度倾向,本申请的疫苗在接种时在皮肤及皮下进行增殖,从而刺激免疫,但由于只能在低于体温的温度下生长,在体内中心抑制了增殖,故感染可能性低,因此在包括结核分枝杆菌的所有分枝杆菌感染症的预防疫苗及免疫治疗中能够安全及有效地使用。尤其是作为活菌,在分枝杆菌感染症的预防疫苗及免疫治疗中能够安全及有效地使用。
附图说明
图1为表示本申请的菌株为新型菌株的结果,图1a为16sRNA、rpoB及hsp65的系统分析结果,图1b至图1d分别为本申请菌株的16sRNA、rpoB及hsp65的序列。
图2a及图2b为查明M.paragordonae特征的图表,分别在30℃及37℃下、7H9液体培养基中的生长速度与亚洲分枝杆菌(M.asiaticum)、戈登分枝杆菌(M.gordonae)及海分枝杆菌(M.marinum)相比较而测定的图表。
图3为根据本申请的一实现例,对M.gordonae,M.marinum及M.paragordonae的J774鼠巨噬细胞株进行体外感染测试的结果。在30℃和37℃下进行感染后,一天、三天、五天后溶解细胞,并以适当的稀释倍数涂抹于7H10固体培养基后在30℃下进行培养,之后对所生长的群体数量计数而进行比较并以图表表示。左侧图表为包括M.paragordonae、M.gordonae及M.marinum结果而比较的图表,右侧图表为比较M.paragordonae和M.gordonae之间区别的图表。
图4为根据本申请的一实现例,将M.gordonae、M.marinum及M.paragordonae感染给小鼠后,取出肝脾后将其均质化,并以适当的稀释倍数涂抹于7H10固体培养基后,在30℃下进行培养的结果。
图5为采用M.paragordonae的脓肿分枝杆菌(M.abscessus)相关菌株的疫苗测试结果。图5a示意地表示疫苗接种程序,图5b为根据图5a,通过皮下注射对小鼠(BALB/c,七周龄,n=4)的尾巴根部接种两次M.paragordonae后,采用M.abscessus相关菌株(M.abscessus subsp.bolletii 50594)进行攻击(尾巴静脉注射),并且按日期取出脏器后测定脏器内M.abscessus subsp.bolletii 50594菌的CFU的结果。图5c为采用M.abscessussubsp.bolletii 50594菌进行攻击后第三天、第14天进行IFN-γ酶联免疫斑点检测(ELISPOT)的结果。
图6为采用M.paragordonae的M.tuberculosis H37Ra疫苗检测结果。图6a示意地表示疫苗接种程序,图6b为根据图6a对小鼠(BALB/c,七周龄,n=6)的尾巴根部按实验组接种BCG及M.paragordonae后,采用M.tuberculosis H37Ra进行攻击(尾巴静脉注射),并且按日期取出脏器后测定脏器内M.tuberculosis H37Ra菌的CFU的结果。图6c为对采用M.tuberculosis H37Ra菌进行攻击后第四周、第八周获得的脾细胞进行IFN-γELISPOT的结果。图6d为使采用M.tuberculosis H37Ra菌进行攻击后第四周、第八周获得的脾细胞与抗原(M.tuberculosis H37Ra全蛋白)进行反应并且培养后,对细胞培养液内的IFN-γ、TNF-a及IL-2进行ELISA的结果。图6e为通过ELISA观察与采用M.tuberculosis H37Ra菌进行攻击后第四周、第八周获得的血清内的抗原反应的(M.tuberculosis H37Ra全蛋白及Ag85B蛋白)IgG2a抗体的结果。
具体实施方式
本申请是基于新型分枝杆菌菌株的发现以及所述菌株能够有效作为分枝杆菌感染症疫苗来使用这一发现来做出的,所述新型分枝杆菌菌株为缓慢生长型暗产色菌。
本申请的菌株是从肺感染患者分离的,经过16sRNA分析、耐酸性(acid fastness)分析、生长特征及系统分析的结果,查明该菌株为与属于分枝杆菌群的戈登分枝杆菌(Mycobacterium gordonae)相似(序列一致性为99.0%)的菌株。
本申请中分离的菌株在形态学上与Mycobacterium gordonae相似,但发现本申请的菌株为温度敏感性菌株,其最佳生长温度为25-30℃,在37℃则不生长,这一点与Mycobacterium gordonae不同。而且,经过脂质分析、基于hsp65及rpoB所进行的系统分析及DNA-DNA相关性分析的结果,查明本申请的菌株为新型菌株,将其命名为Mycobacteriumparagordonae,并于2014年7月17日保藏于KCTC韩国典型培养物保藏中心(韩国生命工学研究院微生物资源中心),保藏编号为KCTC12628BP。
本申请的新型温度敏感性分枝杆菌M.paragordonae(菌株49061)能够有效用于分枝杆菌感染的预防。因此,本申请的一方面涉及一种包含新型温度敏感性分枝杆菌M.paragordonae(菌株49061)的免疫原性组合物、疫苗组合物或免疫治疗用组合物。
已知分枝杆菌为引起如结核的肺疾病、淋巴腺炎、皮肤及软组织感染、骨感染症或播散性疾病的原因菌。例如,属于龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium chelonae-M.abscessus complex)的分枝杆菌在具有免疫能力或者免疫力差的对象中引起免疫渗透性皮肤及软组织感染、结核、血液炎症或脓肿(Griffith DE et al.,Am Rev RespirDis.1993;147:1271-8;Wallace RJ Jr,et al.,Rev Infect Dis.1983;5:657-79)。
本申请的疫苗可作为对这种分枝杆菌感染症疾病的疫苗来使用。在一实现例中,该疫苗表现出对包括NTM(nontuberculous mycobacteria)、结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis)或牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)的分枝杆菌感染的保护效果。在另一实现例中,NTM例如包括龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium chelonei complex)、M.aviumcomplex(MAC)、M.avium、M.intracellulare、M.kansasii、M.abscessus或M.massiliense。而且,本申请的疫苗起作用的NTM包括快速发育型NTM。
在本申请的一实现例中,本申请的疫苗组合物尤其可作为由包括龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium chelonae-M.abscessus complex)、结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis)或牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)等的分枝杆菌引起的疾病的疫苗来使用。
本申请的疫苗组合物能够诱导对分枝杆菌的免疫反应,例如生产抗体及/或诱导T-细胞反应,由此能够预防包括龟分枝杆菌复合群、结核分枝杆菌及牛分枝杆菌的分枝杆菌的感染,或者减轻、缓解及/或治疗因感染的症状。
在本申请的组合物中使用的分枝杆菌M.paragordonae(菌株49061)如前所述,可以使用活的活菌、通过化学或热方式杀死的死菌或灭活菌。活菌可以使用经减毒过程的活菌。可通过公知方法来进行减毒,由此能够减少或消除细菌的病原性。在一实现例中,如本申请的说明书中所记载,本申请的疫苗为温度敏感性菌株,其作为活菌具有安全性,因此可以不经减毒过程而使用,具有与使用其他种类菌株的疫苗不同的优点。
在一实现例中,本申请使用活菌。在本申请的组合物中使用的M.paragordonae为温度敏感性菌株,以活菌状态使用尤其有利。活菌疫苗与灭活疫苗相比能够诱导先天免疫及适应免疫反应,因此有利于诱导保护性免疫。而且,活菌疫苗能够形成经持续抗原刺激的记忆免疫细胞,因此有利于免疫。本申请的M.paragordonae如本申请的实施例中所述,与作为对照菌株使用的M.gordonae、M.marinum,M.bovis BCG相比,感染后在脏器内的CFU(菌簇形成单位,colony forming unit)低,这表示本申请的疫苗安全,能够作为活菌疫苗来使用,具有与使用其他种类菌株的疫苗不同的优点。
本申请的疫苗组合物可剂型化为全身或局部给药用药剂,可以包含药学上可接受的赋形剂、载体及/或介质,例如磷酸缓冲用食盐水溶液、蒸馏水、水/乳乳剂、润湿剂、乳化剂、pH调节剂等,但并不限于此。
本申请的疫苗组合物可进一步包含佐剂,尤其可以包含能够促进或增强T-细胞介导反应的任一种物质或化合物。在一实现例中,佐剂可在组合物中含有通过化学或热方式杀死的菌的情况下使用。佐剂是本领域中公知的,例如可使用氢氧化铝、磷酸铝、硫酸铝钾、交联聚丙烯酸聚合物、DDA(dimethyldioctadecyl-ammonium bromide)、免疫调节物质、乳铁蛋白或IFN-γ诱导剂等。在一实现例中,所述交联聚丙烯酸聚合物可包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质可包括IFN-γ、IL-1、IL-2或IL-12,所述IFN-γ诱导剂可包括poly I:C,但并不限于此。在一实现例中,所述氢氧化铝、磷酸铝或硫酸铝钾的含量可为约0.05~0.1wt%,所述交联聚丙烯酸聚合物的含量可为0.25wt%,但并不限于此。
本申请的组合物可以局部或全身给药,可以一次或多次给药,可通过多种路径,例如皮下、皮内、肌内或静脉给药,或者通过口服、经鼻或吸入通道给药。在本申请的一实现例中,通过肌内注射一次性给药。根据给药路径、对象或患者的年龄、体重、原发疾病、性别及/或健康状态,疫苗给药量也不同,本领域技术人员可根据本申请说明书的记载及本领域的常识确定适当的量。
本申请的疫苗组合物可制成适于给药路径的液状溶液或悬浮剂,或可剂型化为在注射之前溶解或悬浮于溶液中的固态形式。
在另一实现例中,本申请还涉及一种分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,该方法包含步骤:对需要治疗或预防分枝杆菌感染症的对象,给予治疗上有效量的本申请的疫苗组合物。
在本申请中,治疗上有效量表示在实现本申请的效果例如分枝杆菌感染症的预防或治疗效果中所需的给药期间的给药量。治疗上有效的量可根据给药路径、给药次数、对象的病情、性别、原发疾病、体重及/或本申请的疫苗组合物在对象中表现效果的程度等而不同。治疗上有效的量确定为治疗效果比副作用或毒性大的量。本领域技术人员可根据本领域知识,通过实验来确定针对每个对象的治疗上有效的量。
在本申请中,对象为需要治疗或预防分枝杆菌感染症的哺乳类尤其是人类。
在本申请中,治疗表示通过本申请的组合物的给药来使病情好转或向有利方向改变的所有行为。本申请所属技术领域的技术人员可参照韩国医学学会等提示的资料,了解疾病的正确的标准,并且判断改善、提高及治疗的程度。
在本申请的一实现例中,分枝杆菌感染症由NTM(nontuberculousmycobacteria)、结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)或牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)引起的。在另一实现例中,NTM包括龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium chelonei complex)、鸟分枝杆菌复合群(M.avium complex)(MAC)、鸟分枝杆菌(M.avium)、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)、脓肿分枝杆菌(M.abscessus)或马赛分枝杆菌(M.massiliense)。
本申请的疫苗起作用的分枝杆菌感染症包括肺疾病、淋巴腺炎、皮肤软组织感染症、骨感染症或播散性疾病,本领域技术人员能够正确了解这些疾病的定义、判断标准,并且判别需要进行本申请的疫苗治疗的对象或患者。
在本申请的方法中使用的疫苗所包含的菌为活菌、减毒活菌或灭活菌,尤其是作为温度敏感性菌株,能够作为活菌安全及更加有效地使用。本领域技术人员能够考虑具体感染菌或疾病的种类、感染程度或疾病程度、对象的原发疾病等来给予适当量。
在本申请的方法中使用的疫苗可进一步包含佐剂,本领域技术人员能够考虑具体感染菌或疾病的种类、感染程度或疾病程度、对象的原发疾病等来选择与疫苗共同使用的佐剂,例如佐剂包括氢氧化铝、磷酸铝、硫酸铝钾、交联聚丙烯酸聚合物、DDA(dimethyldioctadecyl-ammonium bromide)、免疫调节物质、乳铁蛋白或IFN-γ诱导剂中的一种以上。在一实现例中,交联聚丙烯酸聚合物可包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质可包括IFN-γ、IL-1、IL-2或IL-12,所述IFN-γ诱导剂可包括poly I:C。在另一实现例中,交联聚丙烯酸聚合物包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质包括IFN-γ、IL-1、IL-2或IL-12,所述IFN-γ诱导剂包括poly I:C。
为了帮助本发明的理解,下面示出实施例。但以下实施例只是为了更加易于理解本发明而提供的,本发明并不限于以下的实施例。
实施例
实施例1:菌株分离及鉴定
按以往资料中的记载(Mun et al.,(2008).Mycobacterium senuense sp.nov.,aslowlygrowing,non-chromogenic species closely related to the Mycobacteriumterrae complex.Int J Syst Evol Microbiol 58,641-646.),从具有症状的肺感染患者的痰试样中分离菌株。
按以往资料中对相关菌株Mycobacterium asiaticum ATCC 25276T及M.gordonaeATCC 14470T的记载,对分离的菌株进行生化分析(Kent&Kubica,(1985).Public HealthMycobacteriology:a Guide for the Level III Laboratory.Atlanta:Centers forDisease Control and Prevention.1985;Pfyffer,Mycobacterium:Generalcharacteristics,laboratory detection,and staining procedures.In Manual ofClinical C Microbiology,9th edn,vol.1,p.559,573-578.Edited by P.R.Murray,E.J.Baron,J.H.Jorgensen,M.L.Landry&M.A.Pfaller.Washington:American EX Societyfor Microbiology.)。
简而言之,在补充有OADC(油酸-白蛋白-葡萄糖-过氧化氢酶,Oleic AlbuminDextrose Catalase)的Middlebrook 7H10琼脂平板上将所述菌株培养六周后,进行了群体形态、在暗环境下的色素沉积、在光诱导及多种温度下的生长与否、烟酸蓄积、硝酸盐还原酶、吐温(Tween)80水解、脲酶及吡嗪酰胺酶、噻吩-2-羧酸肼(TCH,thiophene-2-carboxylic acid hydrazide)耐性、对硝基苯甲酸(PNB,p-nitrobenzoate)、5%氯化钠、乙胺丁醇及苦味酸分析。
在表1中示出结果。
[表1]
*Y:黄色;W:白色;O:橘黄色
S:黑暗产色;P:光照产色
在表1中,1、2、3表示所使用的菌株,分别如下:1为本申请菌株M.paragordonae(菌株49061);2为M.asiaticum ATCC 25276T;3:M.gordonae ATCC 14470T。将符号说明如下:+++为强劲生长;++为良好生长;+为正生长;-为负/未生长;±为变异。所有菌株表现为光滑型菌落,在45℃下未生长。
本实施例的菌株形态学上为弯曲形状较多的棒状、且表现出耐酸性的菌株,在显微镜下未发现孢子或丝体。最佳生长温度为25-30℃,在37℃或45℃下未生长。在Middlebrook 7H10琼脂平板上表现出橘黄色的光滑型菌落。在包含苦味酸的培养基中未生长,脲酶活性为阳性。在DNA-DNA关联度分析中,最有关联性的种的关联度低于70%。在使用MALDI-TOF MS的脂质分析中,表现出与其他种不同,表现出在16S rRNA(1393bp)、rpoB(306bp)及hsp65(603bp)基因上具有固有序列(参照图1b、图1c及图1d)。而且,经过系统分析发现所分离的菌株为缓慢生长型分枝杆菌。16S rRNA为可区分属的基因,hsp65、rpoB为可区分种间的基因,16S rRNA、hsp65基因的碱基序列与M.gordonae相似,但各自的碱基序列一致性为99%、95.9%,与M.gordonae具有特异性序列,rpoB基因的碱基序列与M.asiaticum相似,但碱基序列一致性为95.4%,可见这也具有特异性碱基序列(图1a)。这种结果表示本申请的菌株为新型的。
将本细菌命名为Mycobacterium paragordonae,并于2014年7月17日保藏于韩国生命工学研究院微生物资源中心,保藏编号为KCTC12628BP。
实施例2:Mycobacterium paragordonae菌株的温度敏感性特征确认及安全性分析
为了证明活疫苗接种时的安全性,进行以下实验。
首先,为了确认温度敏感性分枝杆菌菌株(Mycobacterium paragordonae,菌株49061)是否确实在37℃下不生长,通过吸光度,将其起始接种量设置为与其他对照菌株(M.gordonae、M.asiaticum及M.marinum)一致后,在液体培养基(Middlebrook 7H9)中,在30℃、37℃温度下,通过吸光度且按时间(一天、三天、五天、七天)测定生长与否,并在图2中示出结果。从图中可知,温度敏感性分枝杆菌M.paragordonae(菌株49061)在与正常体温(37℃)相当的温度下不生长,但在更低的温度(30℃)下良好生长。
之后进行感染分析。感染分析是为了确认以下内容而进行的:M.paragordonae菌株在液体培养基和固体培养基中培养时具有在37℃下不生长的特征,因此在实际上感染到巨噬细胞时,在不同的温度下的表现是否也不同。为此,在30℃和37℃下将菌感染(~1×107,10M.O.I.)到巨噬细胞(J774细胞株,ATCC TIB-67TM)后溶解细胞(添加含有0.5%TritonTM X-100的PBS后,通过移液方式分离细胞),之后在7H10固体培养基上涂抹后在30℃下培养,然后计测所生成的群体数。
在图3中示出结果。如图所示,与对照菌株不同,在37℃下感染的M.paragordonae基本上未生长。
并且,作为活体实验,对BALB/c小鼠(七周龄,n=3)静脉注射M.paragordonae及对照菌株(106CFU)来感染后,在第一天、第四天和第七天取出肝脾并进行均质化,之后用磷酸缓冲溶液稀释后,在7H10固体培养基中植板(plating),在30℃下培养后测定CFU。
在图4a中示出结果,如图所示,在测定M.paragordonae在肝或脾中的生长情况的结果,与其他菌株相比基本上未生长,这表示本申请菌株在活体中使用时安全。
并且,作为活体实验,对BALB/c小鼠(七周龄,n=3)静脉注射M.paragordonae及对照菌株(M.gordonae、M.marinum或M.bovis BCG)(106CFU in 100μl PBS)来感染后,(与M.gordonae、M.marinum比较时)在第一天、第四天和第七天,或者(与M.bovis BCG比较时)在第一天、第七天和第14天取出肝脾并进行均质化,之后用磷酸缓冲溶液稀释后,在7H10固体培养基中植板,在30℃下培养后测定CFU。
在图4b中示出结果,如图所示,在测定M.paragordonae在肝或脾中的生长情况的结果,与其他菌株相比基本上未生长。
实施例3:Mycobacterium paragordonae疫苗分析
接着以如下方式进行疫苗分析。首先,如图5a的程序,对ALB/c小鼠(七周玲,n=4)的尾巴静脉注射两次(第0周和第八周)106CFU的M.paragordonae(菌株49061)。将PBS和BCG作为对照组使用。接着在第12周对尾巴根部皮下注射106CFU的M.abscessus相关菌株(M.abscessus subsp.bolletii 50594)。接着在三天和14天后,按照实施例2的方式测定各脏器(肝、脾、肺)的M.abscessus subsp.bolletii 50594的CFU。用M.abscessussubsp.bolletii 50594菌进行攻击的14天后取出脾脏,并且为了检测当对脾细胞内处理M.abscessus subsp.bolletii 50594菌株的全蛋白时分泌IFN-γ的细胞数量,实施ELISPOT。具体在具有PVDF膜的96孔板中放入IFN-γ抗体(eBiosciense,Cat.,16-7313-85,3μg/ml)后在4℃下培养一天。次日洗涤各孔后,填充完全培养基(DMEM+抗生素+10%FBS)并在37℃下培养。取出每个小鼠的脾脏,用70μm细胞筛获得脾细胞,将各组脾细胞数量设为约5×105细胞后,加入经培养的涂有PVDF的96孔板的各孔中。接着用抗原处理组处理M.abscessus subsp.bolletii 50594全蛋白10μg/ml,剩下的用完全培养基处理。用PMA(佛波醇豆蔻酸乙酸酯,Phorbol myristate acetate)(5ng/ml)和离子霉素(iononmycin)(500ng/ml)进行处理以作为阳性对照组。然后在37℃下培养一天,次日经洗涤后对各孔处理检测抗体(eBiosciense,Cat.,13-7311-85,3μg/ml)。接着在4℃下培养一天后洗涤各孔,用辣根过氧化物酶标记链霉亲和素(streptavidin-HRP)进行处理并在室温下培养两个小时后进行洗涤,之后按照制造商的方法使用AEC(3-氨基-9-乙基咔唑,3-amino-9-ethylcarbazole)底物显色试剂盒(Dako)进行显色后观察斑点。其次,按照图6a中记载的方法,对BALB/c小鼠(七周龄,n=6)的尾巴根部皮下注射两次(第0周和第八周)106CFU的M.paragordonae(菌株49061),并进行疫苗分析。实验组如下。实验组1:皮下注射两次PBS,实验组2:皮下注射两次BCG,实验组3:皮下注射一次BCG后皮下注射一次M.paragordonae,实验组4:皮下注射两次M.paragordonae。接着在第12周对尾巴静脉注射106CFU的非病原性结核分枝杆菌M.tuberculosis H37Ra。接着在四周后,按照实施例2的方式测定各脏器(肝、脾、肺)的M.tuberculosis H37Ra的CFU。用M.tuberculosis H37Ra菌进行攻击的四周和八周后取出脾脏,为了检测当对脾细胞内处理M.tuberculosis H37Ra菌株的全蛋白时分泌IFN-γ的细胞数量,实施ELISPOT,并对经抗原处理后排出到细胞培养液中的TNF-α、IFN-γ及IL-2实施ELISA。ELISA采用R&D systems(TNF-α,Cat.No.,DY410)或BioLegend公司(IFN-γ,Cat.No.,430805;IL-2,Cat.No.,431002)提供的试剂盒,按照制造商的方法执行。接着在四周和八周后收集的血液试样中分离血清,为了分析血清内的与M.tuberculosis H37Ra全蛋白及Ag85B抗原反应的免疫球蛋白G2a类型的表达差,对IgG2a进行ELISA。
在图5和图6中示出结果。在图5b中,接种M.paragordonae的小鼠脏器中M.abscessus subsp.bolletii 50594的CFU少于接种PBS或接种其他M.gordonae及M.bovisBCG的小鼠脏器中的CFU。而且对IFN-γ实施ELISPOT的结果,接种M.paragordonae的小鼠中观察到更多的斑点。疫苗测试后的CFU结果表示M.paragordonae赋予了对M.abscessussubsp.bolletii 50594的防御能力。
而且,与以往的M.bovis BCG相比,随着减少M.abscessus相关菌株的CFU,对M.abscessus相关菌株的防御能力更高。而且,通过ELISPOT观察到将M.paragordonae用作疫苗时,脾细胞内的对M.abscessus subsp.bolletii 50594的防御免疫细胞的数量多于使用BCG时的数量,表示M.paragordonae能够赋予对包括M.abscessus subsp.bolletii50594的龟分枝杆菌复合群的有效的防御能力。
在图6b中,接种M.paragordonae的小鼠脏器中M.tuberculosis H37Ra的CFU远少于PBS处理组的CFU,与接种两次BCG的组相比,接种两次M.paragordonae的组在统计学上有意义地表现出有低的CFU。对IFN-γ实施ELISPOT时,接种两次M.paragordonae的小鼠脾细胞与接种BCG及接种两种菌株的小鼠脾细胞相比有统计学意义地观察到更多的斑点(图6c)。而且,通过ELISA观察由M.tuberculosis H37Ra全蛋白刺激从各实验组取出的脾细胞后表达于细胞培养液中的细胞活素时,发现接种M.paragordonae菌株的脾细胞中干预保护性免疫的IFN-γ、TNF-α及IL-2的表达不仅比PBS实验组、还比其他实验组有了有意义的增加(图6d)。最后,通过ELISA观察各实验组小鼠血清内对M.tuberculosis H37Ra的IgG2a抗体的表达程度。已知IgG2a抗体主要通过Th1-型免疫反应形成,且IgG2a抗体为与疫苗功效有关的抗体的同种型。经IgG2a抗体的ELISA结果,发现与接种PBS或BCG的实验组相比,接种M.paragordonae的实验组的血清试样中有意义地存在较多对M.tuberculosis H37Ra全蛋白及Ag85B抗原的IgG2a抗体(图6e)。这种结果表示M.paragordonae赋予了对M.abscessussubsp.bolletii 50594及M.tuberculsos H37Ra的防御能力。
进一步,本申请的疫苗自然具有对温度敏感的特征,因此也能保证安全性,不仅对人类,还对动物,能够作为对包括龟分枝杆菌复合群、结核杆菌及牛分枝杆菌的分枝杆菌感染症的疫苗有效使用。
上面详细说明了本申请的示意性实施例,但本申请的权利范围不限于上述内容,本领域技术人员利用所附的权利要求书中界定的本申请基本概念而进行的各种变形及改良形式也属于本申请的权利范围。
除非有不同的定义,本发明中使用的所有技术术语作为与本发明相关领域的普通技术人员通常理解的含义相同的含义使用。本说明书中作为参考文献来记载的所有出版物的内容援引于本发明中。
[保藏编号]
保藏机构名:韩国生命工学研究院
保藏编号:KCTC 12628BP
保藏日:2014年7月17日
PCT/RO/134表

Claims (18)

1.一种分枝杆菌感染症疫苗组合物,包含:保藏编号为KCTC12628BP的paragordonae分枝杆菌(Mycobacterium paragordonae,菌株49061)菌株及药学上可接受的赋形剂。
2.根据权利要求1所述的疫苗组合物,所述分枝杆菌感染症为由非结核性分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria)、结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)或牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)引起的。
3.根据权利要求2所述的疫苗组合物,所述非结核性分枝杆菌为龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium chelonae complex)、鸟分枝杆菌复合群(M.avium complex)(MAC)、鸟分枝杆菌(M.avium)、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)、脓肿分枝杆菌(M.abscessus)或马赛分枝杆菌(M.massiliense)。
4.根据权利要求1所述的疫苗组合物,所述分枝杆菌感染症为肺疾病、淋巴腺炎、皮肤软组织、骨感染症或播散性疾病。
5.根据权利要求1所述的疫苗组合物,所述菌株为活菌或死菌。
6.根据权利要求1所述的疫苗组合物,所述组合物进一步包含佐剂。
7.根据权利要求6所述的疫苗组合物,所述佐剂为氢氧化铝、磷酸铝、硫酸铝钾、交联聚丙烯酸聚合物、双十八烷基二甲基溴化铵(dimethyldioctadecyl-ammonium bromide)、免疫调节物质、乳铁蛋白或γ-干扰素诱导剂中的一种以上。
8.根据权利要求7所述的疫苗组合物,所述交联聚丙烯酸聚合物包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质包括γ-干扰素、白细胞介素-1、白细胞介素-2或白细胞介素-12,所述γ-干扰素诱导剂包括聚肌胞苷酸。
9.根据权利要求7所述的疫苗组合物,所述氢氧化铝、磷酸铝或硫酸铝钾的含量为0.05~0.1wt%,所述交联聚丙烯酸聚合物的含量为0.25wt%。
10.一种分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,包含步骤:对需要治疗或预防分枝杆菌感染症的对象,给予有效量的权利要求1至9中的任一项所述的疫苗组合物。
11.根据权利要求10所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述分枝杆菌感染症由非结核性分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria)、结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis)或牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)引起的。
12.根据权利要求11所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述非结核性分枝杆菌为龟分枝杆菌复合群(Mycobacterium chelonei complex)、鸟分枝杆菌复合群(M.aviumcomplex,MAC)、鸟分枝杆菌(M.avium)、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)、脓肿分枝杆菌(M.abscessus)或马赛分枝杆菌(M.massiliense)。
13.根据权利要求10所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述分枝杆菌感染症为肺疾病、淋巴腺炎、皮肤软组织感染症、骨感染症或播散性疾病。
14.根据权利要求10所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述菌株为活菌、减毒活菌或灭活菌。
15.根据权利要求10所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述组合物进一步包含佐剂。
16.根据权利要求15所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述佐剂为氢氧化铝、磷酸铝、硫酸铝钾、交联聚丙烯酸聚合物、双十八烷基二甲基溴化铵(dimethyldioctadecyl-ammonium bromide)、免疫调节物质、乳铁蛋白或γ-干扰素诱导剂中的一种以上。
17.根据权利要求16所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述交联聚丙烯酸聚合物包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质包括γ-干扰素、白细胞介素-1、白细胞介素-2或白细胞介素-12,所述γ-干扰素诱导剂包括聚肌胞苷酸。
18.根据权利要求17所述的分枝杆菌感染症的预防或治疗方法,所述交联聚丙烯酸聚合物包括均聚物或共聚物,所述免疫调节物质包括γ-干扰素、白细胞介素-1、白细胞介素-2或白细胞介素-12,所述γ-干扰素诱导剂包括聚肌胞苷酸。
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